非标准遗传密码表对照：线粒体、细菌与纤毛虫密码子差异速查
NCBI 定义的全部 27 张遗传密码表，以及每一张与标准表的逐个密码子差异。 下面还有一个查询框：选表号、填密码子，直接看该表下编码什么。
NCBI 全部 27 张遗传密码表
| 表号 | 名称 | 与标准表差异 | 终止密码子 | 起始密码子 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 标准遗传密码 The Standard Code (transl_table=1) |
— | TAA TAG TGA | ATG CTG TTG |
| 2 | 脊椎动物线粒体 The Vertebrate Mitochondrial Code (transl_table=2) |
4 | AGA AGG TAA TAG | ATA ATC ATG ATT GTG |
| 3 | 酵母线粒体 The Yeast Mitochondrial Code (transl_table=3) |
6 | TAA TAG | ATA ATG GTG |
| 4 | 霉菌/原生生物/腔肠动物线粒体，及支原体/螺原体 The Mold, Protozoan, and Coelenterate Mitochondrial Code and the Mycoplasma/Spiroplasma Code (transl_table=4) |
1 | TAA TAG | ATA ATC ATG ATT CTG GTG TTA TTG |
| 5 | 无脊椎动物线粒体 The Invertebrate Mitochondrial Code (transl_table=5) |
4 | TAA TAG | ATA ATC ATG ATT GTG TTG |
| 6 | 纤毛虫/羽藻/六鞭毛虫核 The Ciliate, Dasycladacean and Hexamita Nuclear Code (transl_table=6) |
2 | TGA | ATG |
| 9 | 棘皮动物与扁形动物线粒体 The Echinoderm and Flatworm Mitochondrial Code (transl_table=9) |
4 | TAA TAG | ATG GTG |
| 10 | 游仆虫核 The Euplotid Nuclear Code (transl_table=10) |
1 | TAA TAG | ATG |
| 11 | 细菌、古菌与植物质体 The Bacterial, Archaeal and Plant Plastid Code (transl_table=11) |
0 | TAA TAG TGA | ATA ATC ATG ATT CTG GTG TTG |
| 12 | 替代酵母核 The Alternative Yeast Nuclear Code (transl_table=12) |
1 | TAA TAG TGA | ATG CTG |
| 13 | 海鞘线粒体 The Ascidian Mitochondrial Code (transl_table=13) |
4 | TAA TAG | ATA ATG GTG TTG |
| 14 | 替代扁形动物线粒体 The Alternative Flatworm Mitochondrial Code (transl_table=14) |
5 | TAG | ATG |
| 15 | Blepharisma 核 Blepharisma Nuclear Code (transl_table=15) |
1 | TAA TGA | ATG |
| 16 | 绿藻线粒体 Chlorophycean Mitochondrial Code (transl_table=16) |
1 | TAA TGA | ATG |
| 21 | 吸虫线粒体 Trematode Mitochondrial Code (transl_table=21) |
5 | TAA TAG | ATG GTG |
| 22 | Scenedesmus obliquus 线粒体 Scenedesmus obliquus Mitochondrial Code (transl_table=22) |
2 | TAA TCA TGA | ATG |
| 23 | Thraustochytrium 线粒体 Thraustochytrium Mitochondrial Code (transl_table=23) |
1 | TAA TAG TGA TTA | ATG ATT GTG |
| 24 | 羽鳃纲线粒体 Rhabdopleuridae Mitochondrial Code (transl_table=24) |
3 | TAA TAG | ATG CTG GTG TTG |
| 25 | SR1 与 Gracilibacteria Candidate Division SR1 and Gracilibacteria Code (transl_table=25) |
1 | TAA TAG | ATG GTG TTG |
| 26 | Pachysolen tannophilus 核 Pachysolen tannophilus Nuclear Code (transl_table=26) |
1 | TAA TAG TGA | ATG CTG |
| 27 | Karyorelict 核 Karyorelict Nuclear Code (transl_table=27) |
3 | ATG | |
| 28 | Condylostoma 核 Condylostoma Nuclear Code (transl_table=28) |
3 | ATG | |
| 29 | Mesodinium 核 Mesodinium Nuclear Code (transl_table=29) |
2 | TGA | ATG |
| 30 | 缘毛类核 Peritrich Nuclear Code (transl_table=30) |
2 | TGA | ATG |
| 31 | Blastocrithidia 核 Blastocrithidia Nuclear Code (transl_table=31) |
3 | ATG | |
| 32 | 蛇菰科质体 Balanophoraceae Plastid Code (transl_table=32) |
1 | TAA TGA | ATA ATC ATG ATT CTG GTG TTG |
| 33 | 头盘虫科线粒体 UAA-Tyr Cephalodiscidae Mitochondrial UAA-Tyr Code (transl_table=33) |
4 | TAG | ATG CTG GTG TTG |
各表与标准表的逐个密码子差异
| 表号 | 密码子 | 标准表 | 该表 |
|---|---|---|---|
| 2 | AGA |
R | 终止 |
| 2 | AGG |
R | 终止 |
| 2 | ATA |
I | M |
| 2 | TGA |
终止 | W |
| 3 | ATA |
I | M |
| 3 | CTA |
L | T |
| 3 | CTC |
L | T |
| 3 | CTG |
L | T |
| 3 | CTT |
L | T |
| 3 | TGA |
终止 | W |
| 4 | TGA |
终止 | W |
| 5 | AGA |
R | S |
| 5 | AGG |
R | S |
| 5 | ATA |
I | M |
| 5 | TGA |
终止 | W |
| 6 | TAA |
终止 | Q |
| 6 | TAG |
终止 | Q |
| 9 | AAA |
K | N |
| 9 | AGA |
R | S |
| 9 | AGG |
R | S |
| 9 | TGA |
终止 | W |
| 10 | TGA |
终止 | C |
| 11 | — | — | 与标准表完全相同 |
| 12 | CTG |
L | S |
| 13 | AGA |
R | G |
| 13 | AGG |
R | G |
| 13 | ATA |
I | M |
| 13 | TGA |
终止 | W |
| 14 | AAA |
K | N |
| 14 | AGA |
R | S |
| 14 | AGG |
R | S |
| 14 | TAA |
终止 | Y |
| 14 | TGA |
终止 | W |
| 15 | TAG |
终止 | Q |
| 16 | TAG |
终止 | L |
| 21 | AAA |
K | N |
| 21 | AGA |
R | S |
| 21 | AGG |
R | S |
| 21 | ATA |
I | M |
| 21 | TGA |
终止 | W |
| 22 | TAG |
终止 | L |
| 22 | TCA |
S | 终止 |
| 23 | TTA |
L | 终止 |
| 24 | AGA |
R | S |
| 24 | AGG |
R | K |
| 24 | TGA |
终止 | W |
| 25 | TGA |
终止 | G |
| 26 | CTG |
L | A |
| 27 | TAA |
终止 | Q |
| 27 | TAG |
终止 | Q |
| 27 | TGA |
终止 | W |
| 28 | TAA |
终止 | Q |
| 28 | TAG |
终止 | Q |
| 28 | TGA |
终止 | W |
| 29 | TAA |
终止 | Y |
| 29 | TAG |
终止 | Y |
| 30 | TAA |
终止 | E |
| 30 | TAG |
终止 | E |
| 31 | TAA |
终止 | E |
| 31 | TAG |
终止 | E |
| 31 | TGA |
终止 | W |
| 32 | TAG |
终止 | W |
| 33 | AGA |
R | S |
| 33 | AGG |
R | K |
| 33 | TAA |
终止 | Y |
| 33 | TGA |
终止 | W |
为什么需要这张表
用标准遗传密码去翻译线粒体序列会得到错误的蛋白。以脊椎动物线粒体（表 2）为例， 它与标准表有四处不同：TGA 从终止变成色氨酸、ATA 从异亮氨酸变成甲硫氨酸、 AGA 和 AGG 从精氨酸变成终止。按标准表翻译，蛋白会在第一个 TGA 处被错误截断， 而真正的终止信号又读不出来。
GenBank 里用 /transl_table=N 标注该用哪张表，N 就是这里的表号。
做非核基因组、非模式生物或环境样本的序列分析时，先确认表号再翻译。
表 11（细菌、古菌与植物质体）与标准表完全相同，差异为 0—— 它单独列出来是为了让注释流程能明确声明用的是细菌密码，而不是碰巧一样。
数据出处
全部取自 NCBI 的 The Genetic Codes 页面（Elzanowski A, Ostell J 编制， https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi，2024-09-23 更新）。 用 curl 取原始页面后程序解析，没有人工誊抄，也没有经过模型转述。 每张表都验证过恰好覆盖 64 个不重复密码子；差异列由与表 1 逐位比对算出。
常见问题
我怎么知道该用哪张表？
GenBank 记录里 CDS 上的 /transl_table=N 就是表号。做自己的数据时按材料判断：核基因组一般用表 1，细菌用表 11，脊椎动物线粒体用表 2，无脊椎动物线粒体用表 5。非模式生物和环境样本要查该类群的实际用表，不能默认标准表。
表 11 和表 1 完全一样，为什么还要单独列？
差异确实是 0。单独列出来是为了让注释流程能明确声明「这里用的是细菌密码」，而不是碰巧和标准表一样。语义不同，即使数值相同。
用错表会有什么后果？
最典型的是脊椎动物线粒体序列按标准表翻译：TGA 在标准表里是终止，在表 2 里编码色氨酸，蛋白会在第一个 TGA 处被错误截断；同时 AGA/AGG 在表 2 里才是终止，按标准表读成精氨酸，真正的终止信号丢失。
这些表会变吗？
会增补。NCBI 页面最近一次更新是 2024-09-23，表号 24 之后的多张是近年新增的。本页数据由程序从 NCBI 原始页面解析，重新采集即可更新。