在线科研小工具
序列处理
DNA / RNA 反向互补序列在线转换
粘贴序列即得反向互补、互补、反向三种结果,支持 FASTA 与 IUPAC 简并碱基。
DNA 序列 GC 含量与 Tm 值在线计算
计算 GC%、碱基组成、分子量与两种经验 Tm,适合快速检查引物。
DNA 序列翻译成蛋白质(六框翻译)在线工具
标准遗传密码表,支持单框与六框翻译、ORF 查找。
FASTA 文件统计:序列数、长度分布与 N50
粘贴 multi-FASTA,立刻得到条数、总长、N50/L50、GC% 和长度分布。
蛋白质分子量、等电点与 280nm 消光系数在线计算
输入氨基酸序列,算出分子量、理论 pI、摩尔消光系数和 1 mg/mL 的 A280。
双序列比对在线工具(Needleman-Wunsch 全局比对)
两条序列全局比对,给出比对结果、得分、一致度与错配/空位统计。
密码子表速查(标准遗传密码):密码子与氨基酸双向查询
标准遗传密码全部 64 个密码子,支持密码子查氨基酸、氨基酸反查密码子,DNA 与 RNA 写法都认。
氨基酸性质速查表:分子量、侧链 pKa、疏水性与密码子数
20 种标准氨基酸的残基质量、游离分子量、侧链 pKa、Kyte-Doolittle 疏水性与密码子数,支持单字母/三字母/中英文名查询。
常用限制酶识别序列速查表与酶切位点查找
30 种常用限制酶的识别序列、切点、末端类型与平均间隔,并可粘贴序列查找酶切位点(支持线性与环状)。
非标准遗传密码表对照:线粒体、细菌与纤毛虫密码子差异速查
NCBI 全部 27 张遗传密码表,逐个密码子列出与标准表的差异,支持按表号与密码子查询。
密码子偏好性表与稀有密码子扫描(含 CAI 计算)
九个常用物种的密码子使用频率,粘贴 CDS 即可扫描稀有密码子、算 CAI,并给出每个氨基酸在该宿主里的最优密码子。
引物二聚体与发夹结构在线检测(含 3′ 端互补分析)
检测引物的自身二聚体、发夹结构与引物对交叉二聚体,单列 3′ 端连续互补数并画出配对示意。
最近邻法 Tm 计算器
用最近邻热力学模型算引物 Tm,给出 ΔH、ΔS、ΔG37,并把 PCR 缓冲液里的 Mg2+ 与 dNTP 折成钠当量。
FASTQ 质量值换算器
Q 值与错误率互换,并解析 FASTQ 质量串:平均质量按正确算法计算,同时给出 ≥Q20/Q30 占比与期望错误数。
基因组坐标系转换器
BED 与 GFF/VCF/SAM 的坐标差 1,这里一次换清楚,并给出可直接粘贴的 BED 与 GFF 行。
实验计算
离心机 RCF (g) 与 RPM 在线换算
按转子半径在相对离心力与转速之间双向换算,附常见转子半径参考。
摩尔浓度、质量与体积在线换算
已知任意两项求第三项:浓度、体积、质量,支持 mM/µM/nM 与 mg/µg/ng。
溶液稀释计算器 (C1V1 = C2V2)
母液稀释、倍数稀释、系列稀释一次算清,自动给出需加溶剂体积。
核酸浓度换算:OD260、ng/µL 与 pmol 互转
A260 转质量浓度,ng 与 pmol 互转,支持 dsDNA / ssDNA / RNA / 寡核苷酸。
血细胞计数板细胞浓度在线计算
输入各大格计数与稀释倍数,算出细胞浓度、总细胞数与铺板所需体积。
缓冲液配制计算器(Henderson-Hasselbalch)
按目标 pH 算出酸式与碱式组分的比例和各自需要的质量。
PCR 反应体系配制计算器(含多样本预混)
按储液浓度与终浓度算出每种组分取样量与补水量,支持多样本批量预混。
DNA / RNA 拷贝数在线计算(质粒标准品、qPCR、ddPCR)
由浓度和长度算出每微升拷贝数、每管拷贝数与单拷贝质量,并生成标准曲线稀释方案。
引物复溶与稀释计算器
冻干引物复溶加多少水、配工作液怎么稀释,一次算清,并给出这管够做多少个反应。
转化效率计算器
按 CFU/µg 算感受态转化效率,自动折算铺板比例——漏掉这一步会让结果差一个数量级。
细胞培养板与培养瓶换算器(面积 / 接种量 / 加药体积)
按生长面积在培养板、皿、瓶之间换算接种细胞数与加药体积——细胞数跟面积走、药量跟培养基走,而这两个比例并不相等。
百分比浓度换算器(% w/v、% w/w、% v/v、ppm 与 mol/L 互转)
试剂瓶上的 37% 和方案里的 12 mol/L 是同一瓶浓盐酸——% (w/v)、% (w/w)、% (v/v)、ppm、g/L、mol/L 一次换算清楚,并说明它们差在哪。
OD₆₀₀ 与菌液浓度换算(稀释回算 / 酶标仪光程校正 / 接种量反推)
由 OD₆₀₀ 读数算 cells/mL 与总菌数,自动做稀释回算与光程折算,并按读数判断有没有落在线性区——超出线性区的读数会让菌数稳定偏低。
凝胶条带大小估算(DNA bp / 蛋白 kDa,半对数标准曲线)
输入 marker 各带的大小与迁移距离,拟合半对数标准曲线估算未知条带;并指出两个常见错误——在两条带之间按大小线性内插(永远高估),以及对跑出 marker 范围的条带给估计值(那是外推)。
细胞传代比例与汇合时间计算(按倍增时间反推该按几比几分)
输入当前汇合度、倍增时间与目标汇合度,算出按 1:N 传代后多久长回来,或反过来推该按几比几分——分得稀一倍只多买一个倍增周期,不是多买一倍时间。
平板菌落计数与 CFU/mL 换算(可计数范围 / ISO 加权平均 / 泊松误差)
输入各稀释度平板的菌落数,自动判断哪些板可数、按 ISO 4833 加权平均算 CFU/mL,并给出由计数本身带来的误差——可计数范围不是规矩,是 1/√n 定的。
离心 k 因子与转子间时间换算(同样的 g 力,换个转子时间不一样)
由 r_min、r_max 与额定转速算转子 k 因子,按 k 折算换转子后的等效离心时间;RCF 只说明力有多大,沉降要多久还取决于颗粒要走多远。
Gibson 无缝组装片段用量计算器(多片段摩尔比与 pmol 换算)
按载体长度与用量算出每个插入片段该加多少 ng,自动区分 2–3 片段与 4–6 片段两档推荐量,并检查总 pmol 是否落在协议区间内。
酶切体系配制计算器(单位用量、甘油上限与配比)
由 DNA 量与底物类型算出所需酶单位和体积,核对终体系甘油是否超过 5% 这条星号活性的线,并给出 DNA / 缓冲液 / 酶 / 水的完整配比。
缓冲液配制计算器(TAE / TBE / PBS 与自定义配方的称量换算)
选配方、填浓缩倍数与体积,直接给出每个组分称多少克或量多少毫升,算式逐项列出;并提示 EDTA 不调 pH 不溶、Tris 的 pH 随温度变这两个坑。
琼脂糖凝胶浓度选择与称量计算器(附 TBE / TAE 取舍)
按要分辨的片段范围选琼脂糖浓度、按胶盘尺寸算该称多少克,并说明 TBE 与 TAE 该怎么选——这一条影响的是切胶回收之后的下游反应。
渗透摩尔浓度计算器(mOsm 换算与等渗判断)
按「浓度 × 解离粒子数」算出溶液的渗透摩尔浓度,可代入渗透系数 φ 折算实际值,并与血浆 275–295 mOsm/kg 比较判断等渗、高渗还是低渗。
分子量计算器:由化学式算摩尔质量与称量克数
输入化学式算出摩尔质量,支持嵌套括号与水合物(CuSO4·5H2O),并按目标浓度和体积直接给出该称多少克。原子量取 CIAAW 简略标准原子量。
完全培养基配制计算器(血清与添加剂按终体积反算)
填终体积、血清比例和各添加剂的母液倍数,算出基础培养基该取多少、每样加多少;并算给你看「把基础培养基当起始体积」会让血清差多少。
放射性同位素衰变计算器(³²P / ³⁵S / ¹²⁵I / ³H 剩余活度)
按半衰期算出参考日之后还剩多少活度、要多取几倍体积才等效,并给出剩一半、四分之一、一成各需要多少天。
硫酸铵盐析计算器:蛋白质分级沉淀的固体用量
填初始与目标饱和度、溶液体积和操作温度,算出需要加多少克固体硫酸铵,并给出加盐后的体积增量;常数取自 Wingfield (2001) Appendix 3F 的实测表,四个温度各有自己的值。
动物给药量计算器(mg/kg 剂量 → 注射体积 / 批量备药)
输入剂量 (mg/kg)、体重与药液浓度,算出注射体积;支持批量备药并给出各途径最大注射量参考。
比尔-朗伯定律计算器:吸光度、消光系数与浓度互算
输入吸光度、摩尔消光系数、浓度与光程中的任意三个,立刻求出第四个——酶活测定、NAD(H)动力学与小分子定量的日常换算。
缓冲液 pH 温度校正计算器(Tris / HEPES / MOPS)
输入配制温度与使用温度,即得缓冲液 pH 漂移量与室温应调目标值;Tris 每升温 10°C 偏移 0.28 pH,是磷酸盐缓冲液的十倍以上。
圆二色光谱平均残基椭圆率计算器(CD [θ]MRE 与 Δε)
输入 CD 仪器输出的椭圆率(mdeg)、蛋白浓度与光程,即得平均残基摩尔椭圆率 [θ]MRE 和摩尔圆二色性 Δε,内置光程单位换算提示,规避最常见的数量级错误。
ChIP-qPCR 百分比输入法计算器(% Input 富集分析)
输入保留比例与各组 Ct 值,算出各位点 % Input 富集值;支持批量位点与 IgG 对照归一化,避免「忘乘稀释倍数」这一最常见的数量级错误。
克隆存活分析计算器:平板效率与存活分数
输入各组铺板数与克隆数,算出平板效率 PE 和各剂量点存活分数 SF;多剂量点自动拟合线性二次模型,给出 α、β 与 α/β 比值。
数字PCR(ddPCR)绝对定量计算器:泊松公式与置信区间
由阳性液滴数与总液滴数,用泊松修正算出拷贝数浓度和 95% 置信区间;适用于 Bio-Rad QX200 等液滴数字 PCR 平台,无需标准曲线。
透析换液轮次计算器(脱盐 / 去咪唑 / 缓冲液置换)
按缓冲液与样品体积比算出透析所需轮次和各轮残余浓度,并直观量化多轮换液相比一次大体积透析究竟好多少。
细菌 / 细胞倍增时间与生长速率在线计算
输入两个对数期时间点的 OD 值或细胞计数,计算倍增时间(Generation Time)、比生长速率 μ 与增殖代数,并可预测任意时间点的菌量或细胞数。
细胞实验药物配液计算器(DMSO 母液 · 工作液稀释 · 孔内 DMSO 浓度)
由药物质量与分子量算 DMSO 母液配制量;核算每孔加样体积与孔内 DMSO 百分比;加样量低于移液器精度下限时给出水相中间稀释方案。
双荧光素酶报告基因归一化计算器(Firefly / Renilla 相对荧光素酶活性)
粘贴孔板读数即算每孔归一化活性,按组求均值与标准差,对照组自动归一为 1,输出折叠诱导倍数——避免忘除 Renilla 内参导致的数量级误判。
荧光染料标记度(DOL)计算器:抗体与蛋白质荧光标记化学计量
由 A₂₈₀ 与染料峰值吸光度算出标记度(DOL / F·P⁻¹)和蛋白质浓度,内置 FITC、Alexa Fluor 488/555/647、Cy3/Cy5 常数,自动校正 280 nm 处的染料背景——漏掉这一步会让 DOL 低估超过一倍。
FRET 效率与供受体间距在线计算器(荧光共振能量转移 Förster 公式)
荧光共振能量转移(FRET)三向换算:由距离和 Förster 半径算效率 E、由效率反推间距 R、或由供体荧光淬灭直接算效率,内置 Förster 公式,适用 2–14 nm 分子间距分析。
HPLC 色谱柱效计算器:理论塔板数 N、分离度 Rs 与容量因子 k′
输入保留时间与峰宽,算出理论塔板数 N、板高 H、容量因子 k′ 与分离度 Rs,一次确认柱效状态和两峰能否基线分离。
核酸杂交探针 Tm 与洗膜温度计算器(Northern / Southern Blot)
输入探针类型、长度、GC 含量、杂交液 Na⁺ 浓度和甲酰胺比例,计算探针双链 Tm、推荐杂交温度及高低两档洗膜严格度温度,适用于 Northern、Southern blot 与 ISH 探针设计。
细胞培养 CO₂浓度与培养基 pH 换算器
CO₂浓度、NaHCO₃含量与培养基 pH 三向互算;内置 RPMI / DMEM / MEM 预设,支持海拔校正,让「培养基变黄」有公式可查。
缓冲液离子强度计算器(IEX · SEC · EMSA 条件验证)
按各离子浓度与电荷数算出溶液离子强度 I(mol/L),内置 PBS 等预设,帮你在 IEX 上样和 SEC 跑样前快速核对缓冲液配方。
抑制常数 Ki 计算器(Cheng-Prusoff 公式)
由 IC50、底物浓度与 Km,用 Cheng-Prusoff 公式换算酶抑制剂的真实亲和力常数 Ki,支持竞争性、非竞争性与反竞争性三种抑制机制。
DNA 连接反应计算器(载体与插入片段用量 / Ligation)
输入线性化载体的用量与大小、插入片段大小及目标摩尔比,自动计算连接所需插入片段质量与各组分 fmol 数,适用于 T4 连接酶黏端和平端克隆。
限量试剂与理论产率计算器(合成反应 / 生化反应)
输入各反应物的分子量、用量与化学计量系数,立刻找出限量试剂、算出理论产率与百分产率——摩尔比换算是合成实验最容易出错的一步。
液液萃取效率计算器(多次萃取优化与分配系数)
按分配系数和体积算出每轮萃取的累积回收率;支持弱酸/碱的 pH 分配比校正,并对比少量多次与单次大体积萃取的效率差异。
质谱质量误差计算器:ppm 误差与质量窗口在线换算
输入实测与理论 m/z,立刻得到 ppm 误差和 mDa 偏差;或由理论质量和允许 ppm 范围反算 XIC 质量提取窗口,适用于 Orbitrap、Q-TOF 等高分辨质谱日常数据分析。
病毒感染复数 (MOI) 计算器
输入细胞数、目标感染复数与病毒滴度,计算所需病毒体积;基于泊松分布给出理论感染率与单次感染比例,支持由实测感染率反算实际 MOI。
质谱加合物 m/z 计算器(ESI-MS)
输入中性分子精确质量或分子式,算出正负离子模式下各常见加合物([M+H]+、[M+Na]+、[M+2H]²+ 等)的 m/z 值,并支持由实测 m/z 反算中性质量,适用于 LC-MS/MS 与高分辨质谱的日常数据分析。
NGS 文库摩尔浓度与等摩尔混库计算器(Qubit ng/µL 转 nM)
由 Qubit 浓度与 Bioanalyzer 片段长度算出文库摩尔浓度(nM),并给出稀释加水量与等摩尔混库方案。
PCR 程序运行时间计算器(扩增子大小 × 延伸速率一键估算)
输入扩增子大小与聚合酶延伸速率,自动推算每循环延伸时间与总程序耗时;换用快速聚合酶能省多少时间,一眼看清。
肽段碎片离子 m/z 计算器(b / y 离子 MS/MS 谱图注释)
输入单字母肽段序列,一键得到 b / y 离子的精确单同位素 m/z 值;支持氨甲基化 Cys 与氧化 Met,用于 LC-MS/MS 谱图手动注释与鉴定结果核实。
蛋白质净电荷计算器(pH 依赖性)
输入氨基酸序列与目标 pH,按 Henderson-Hasselbalch 方程估算各可电离基团的带电比例与理论净电荷,辅助离子交换树脂选型与等电点区间分析。
蛋白质纯化追踪表:比活度、得率与纯化倍数在线计算
输入各纯化步骤的体积、蛋白浓度与酶活,一键算出比活度、得率与纯化倍数,生成论文规范的纯化追踪表。
SDS-PAGE 凝胶配制计算器(分离胶与浓缩胶)
输入分离胶丙烯酰胺百分比与每块体积,立即得到各试剂取样量——丙烯酰胺、Tris、SDS、APS、TEMED 与加水量,分离胶与浓缩胶同时给出,支持多块预混。
TCID₅₀ 感染滴度计算器(Reed-Muench 累积法)
输入系列稀释孔板的阳性孔数,按 Reed-Muench 法算出比例距与 TCID₅₀/mL,自动生成累积计数中间表,杜绝方向搞反的低级错误。
转染用量计算器(Lipofectamine 3000 / PEI 按生长面积换算)
按培养容器的生长面积等比换算 Lipofectamine 3000 或 PEI 的 DNA 与试剂用量,给出含 10% 余量的预混体积;换算规则能精确复现厂商协议表上的 24 孔板数值。
皮下肿瘤体积计算器(卡尺测量 / TGI 肿瘤生长抑制率)
由卡尺长径与短径算皮下肿瘤体积(mm³),可选改良椭球体或椭球体公式,并可算肿瘤生长抑制率 TGI。
细胞划痕实验分析计算器:伤口愈合率与迁移速率
输入初始与终点划痕宽度,自动算出各复孔伤口愈合率、均值 ± 标准差与每侧前沿迁移速率,适用于细胞迁移与划痕实验数据的批量汇总。
Z' 因子计算器:高通量筛选 (HTS) 检测质量在线评估
粘贴正负对照读数,一键算出 Z' 因子、S/B、S/N 与变异系数,判断检测系统是否达到高通量筛选质量标准。
统计分析
多重检验校正在线计算:BH (FDR)、BY 与 Bonferroni
粘贴一列 p 值,一次得到 BH 的 q 值、BY 与 Bonferroni 校正值,三者并列对照。
qPCR 2^-ΔΔCt 相对定量在线计算
粘贴 Ct 表,自动算 ΔCt、ΔΔCt、相对表达倍数与组内离散度。
基因列表交集并集差集在线计算(Venn 集合运算)
粘贴 2–3 组基因/ID 列表,一键得到交集、并集、各自独有,含去重与大小写归一。
log2FC 与倍数变化 (Fold Change) 在线互转
log2FC ↔ 倍数、上调下调百分比,附常用阈值对照表。
标准曲线线性回归与未知样本反算(BCA / Bradford / ELISA)
粘贴标准品浓度与读数,得到斜率、截距、R²,并反算未知样本浓度。
测序深度与数据量在线计算(Lander-Waterman)
在测序深度、reads 数、数据量与基因组大小之间双向换算。
两组比较样本量估算(t 检验 / 比例检验)
按效应量、显著性水平与把握度,估算每组需要多少样本。
群落多样性指数在线计算(Shannon / Simpson / Chao1)
粘贴物种丰度表,算出 Shannon、Simpson、均匀度与 Chao1 丰富度估计。
富集显著性检验在线计算(超几何分布 / Fisher 精确检验)
输入背景基因数、通路基因数、列表长度与重叠数,算出 p 值、富集倍数与期望重叠。
qPCR 扩增效率与 Pfaffl 相对定量在线计算(标准曲线斜率求 E)
用系列稀释的 Ct 拟合标准曲线,算扩增效率 E 与 R²;再按 Pfaffl 公式做效率校正的相对定量。
RNA-seq 表达量归一化在线计算:RPKM / FPKM / TPM 互算
粘贴基因的 read 数与长度,一次算出 RPKM / FPKM 与 TPM,并直接看出 TPM 合计为 100 万而 RPKM 不是。
t 检验在线计算:独立样本 / 配对样本 / 单样本(含 Welch 校正)
粘贴两组数即可算出 t 值、自由度、双尾 p 值、均值差置信区间与 Cohen's d,默认用 Welch 校正。
单因素方差分析在线计算(含两两比较与多重校正)
三组及以上均值比较,给出 F 值、方差分析表、p 值与 η²,并可做两两比较(Bonferroni 或 BH 校正)。
Mann-Whitney U 与 Wilcoxon 符号秩检验在线计算
偏态数据或等级资料的两组比较,给出 U/W 统计量、精确或近似 p 值、效应量,并提示该样本量下最小可能的 p。
卡方检验与 Fisher 精确检验在线计算(含 OR / RR)
列联表独立性检验,给出 Pearson 卡方、Yates 校正与 Fisher 精确 p 值,2×2 表另给优势比与相对危险度及置信区间。
相关系数在线计算:Pearson、Spearman 与 Kendall
一次算出三种相关系数与各自的 p 值,给出 Pearson 的置信区间与 r²,并在结果异常时提示离群点或非线性。
统计检验怎么选:按数据类型、组数与配对关系对照
回答三个问题就能定下用哪种检验:比数值还是比比例、有几组、是否配对。每一行直接链到对应工具。
米氏方程 Km 与 Vmax 计算(非线性拟合 + 三种线性化对照)
输入若干组底物浓度与反应速率,用非线性拟合求 Km 与 Vmax,并把 Lineweaver-Burk、Hanes-Woolf、Eadie-Hofstee 三种线性化的结果并排列出——它们的分歧本身就是数据质量的读数。
IC50 / EC50 四参数拟合计算器(含数据可信度检查)
输入若干组浓度与响应,用四参数 logistic 拟合 IC50/EC50、Hill 斜率与两端平台,并检查浓度有没有铺到平台、固定斜率会让结果偏多少——这两件事比 R² 重要。
Kaplan-Meier 生存曲线与 log-rank 检验计算器
贴两组的「时间 状态」数据,算出各组 Kaplan-Meier 生存表、中位生存期,以及 log-rank 检验的 χ² 和 p 值;逐时刻明细可直接与教科书演算核对。
药代动力学非房室分析(NCA):AUC、半衰期、清除率在线计算
贴浓度-时间数据和给药剂量,算出 AUC(0→t)、外推到无穷的 AUC、λz 与半衰期、MRT、清除率和表观分布容积;默认用 linear-up/log-down,并算给你看纯线性梯形会高估多少。
ROC 曲线与 AUC 计算器(含 Hanley-McNeil 置信区间)
贴阳性组与阴性组的评分,算出 ROC 表、AUC(梯形法与一致对法互相校验)、Hanley-McNeil 置信区间、Youden J 最优阈值和 Mann-Whitney 检验;也可只填已发表的 AUC 与样本量求置信区间。
诊断试验四格表计算器:灵敏度 / 特异度 / 阳性预测值
输入 TP/FP/FN/TN 四格,一次算出灵敏度、特异度、阳性与阴性预测值、似然比与约登指数,给出 95% Wilson 置信区间,并可用贝叶斯公式更新后验概率。
哈迪-温伯格平衡计算器:等位基因频率、基因型频率与 HWE 偏离检验
输入次等位基因频率或观测基因型计数,给出 HWE 期望频率与 χ² 偏离检验,适用于 GWAS 质控、隐性遗传病携带率估算与遗传风险计算。
科研通用
投稿图件尺寸与分辨率换算(mm / inch / px / DPI)
按期刊要求的栏宽和 DPI 算出图片应有的像素尺寸,并反查现有图片是否达标。
中英混排字数统计(摘要 / 投稿字数限制)
分别统计中文字符数、英文单词数与总字符数,支持排除参考文献与图表标题。
显微镜像素尺寸与 Nyquist 采样(放大倍率够不够,看的是像素不是倍数)
由相机像元、物镜倍率与 NA 算样品面有效像素尺寸(µm/像素)、衍射极限分辨率,并判断是否满足 Nyquist 采样;顺带换算视场宽度与比例尺像素数。
z 堆栈层间距计算器(轴向分辨率与 Nyquist 采样)
填成像方式、发射波长、NA 和浸没介质,算出轴向分辨率和该用多大的 z 层间距,顺带给出拍指定深度要多少层;并说明反卷积为什么要求更密的步长。