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肠道菌群

共 43 篇解读,每天更新。

肠道菌群方向的文献,绝大多数停在「某菌丰度变了」这一层。 稀缺的是代谢物层面的机制,是能不能做因果验证(FMT、单菌定植、代谢物回补), 以及有没有人体数据。一项研究做到了哪一层,基本决定了它值多少分量, 这也是本栏目解读时最先看的东西。

素材来自 PubMed 与 bioRxiv 的当日更新,筛选条件写在检索式里,摘要不足 400 字的不收。

肠道菌群免疫生信方法营养与代谢

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FASTA 文件统计:序列数、长度分布与 N50

粘贴 multi-FASTA,立刻得到条数、总长、N50/L50、GC% 和长度分布。

基因列表交集并集差集在线计算(Venn 集合运算)

粘贴 2–3 组基因/ID 列表,一键得到交集、并集、各自独有,含去重与大小写归一。

log2FC 与倍数变化 (Fold Change) 在线互转

log2FC ↔ 倍数、上调下调百分比,附常用阈值对照表。

Z' 因子计算器:高通量筛选 (HTS) 检测质量在线评估

粘贴正负对照读数,一键算出 Z' 因子、S/B、S/N 与变异系数,判断检测系统是否达到高通量筛选质量标准。

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