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工具实验计算

TCID₅₀ 感染滴度计算器(Reed-Muench 累积法)

输入系列稀释孔板的阳性孔数,按 Reed-Muench 法算出比例距与 TCID₅₀/mL,自动生成累积计数中间表,杜绝方向搞反的低级错误。

方法原理

TCID₅₀(50% 组织培养感染剂量,Tissue Culture Infective Dose 50)由 Reed 和 Muench 于 1938 年提出(Am J Hyg 27:493-497)。它的定义是:某一接种量的病毒液恰好使 50% 的实验孔或动物出现感染终点时,所对应的病毒浓度。终点可以是细胞病变效应(CPE)、荧光、死亡等任何可判读的二元结果。

Reed-Muench 累积法四步走

对病毒原液做系列稀释,每个稀释度接种若干孔,观察并记录各稀释度「阳性孔数/总孔数」。

第一步:累积计数

阳性数从最稀的行开始向上(向浓的方向)逐行累加;
阴性数从最浓的行开始向下(向稀的方向)逐行累加。

感染率% = 累积阳性 / (累积阳性 + 累积阴性) × 100

第二步:定位跨越 50% 的相邻两行

找到感染率刚好高于 50% 的稀释度(称为 A,感染率记为 a%)和相邻更稀一级(称为 B,感染率记为 b%)。

第三步:计算比例距(Proportionate Distance, PD50)

PD50 = (a - 50) / (a - b)

PD50 的值域为 0 到 1,表示 50% 感染点在 A、B 两行之间的相对位置。

第四步:求滴度

d50 = log10(稀释度_A) - PD50 × log10(稀释倍数)

log10(TCID50/mL) = -d50 - log10(接种体积_mL)

接种 100 µL 即 0.1 mL 时,log10(0.1) = -1,所以 log10(TCID50/mL) = -d50 + 1。

可验证算例

以下数据:10 倍稀释、起始 10⁻¹、每稀释度 4 孔、每孔接种 100 µL:

稀释度   阳性/总孔
10⁻¹    4/4
10⁻²    4/4
10⁻³    3/4
10⁻⁴    1/4
10⁻⁵    1/4
10⁻⁶    0/4

累积后各稀释度感染率依次为:100%、100%、83.3%、33.3%、12.5%、0%。

跨越 50% 的相邻两行:10⁻³(83.3%)和 10⁻⁴(33.3%)。

PD50   = (83.3 - 50) / (83.3 - 33.3) = 33.3 / 50 = 0.667
d50    = -3 - 0.667 × 1 = -3.667
log10(TCID50/mL) = 3.667 - log10(0.1) = 3.667 + 1 = 4.667

结果:约 4.6 × 10⁴ TCID₅₀/mL

适用边界

常见错误

  1. 累积方向搞反:阳性从稀到浓方向累积,阴性从浓到稀方向累积,方向不能互换——这是手算最高频的错误。
  2. 忘记折算接种体积:100 µL 与 200 µL 的滴度相差 log₁₀2 ≈ 0.3 个对数单位;漏算这步会带来系统性偏差。
  3. 对全程单调的数据强行插值:若所有稀释度感染率均 > 50% 或均 < 50%,不存在有效的 A/B 组合,不应给出结果。
  4. 混淆 TCID₅₀ 与 LD₅₀:两者算法完全相同,但 LD₅₀ 的终点是动物死亡,单位和解释截然不同,报告时务必明确。

常见问题

TCID₅₀ 和 PFU 有什么区别?

PFU(噬斑形成单位)直接计数可见噬斑,1 PFU 理论上等于 1 个感染性颗粒,精度较高,但要求病毒能产生肉眼可辨的噬斑。TCID₅₀ 基于统计推断,只需出现 CPE 或其他感染终点,适用范围更广。两者可粗略换算:1 PFU ≈ 0.7 TCID₅₀(ln2 的倒数),但因病毒株和细胞系不同差异较大,不应跨方法直接比较绝对滴度。

每个稀释度应该设几个重复孔?

通常 3–4 孔。理论上,若每稀释度设 n 孔、稀释因子为 f,则 95% 置信区间宽度约为 ±1/(n × log₁₀f)。以 4 孔 10 倍稀释为例,误差约 ±0.25 个对数单位,基本满足大多数实验需求;2 孔时误差翻倍,不建议用于定量报告。

为什么需要累积计数,而不是直接用各稀释度的原始感染率?

直接用原始感染率时,只有恰好跨越 50% 的那两行才进入计算,其余行的信息全部丢弃。Reed-Muench 的累积做法把所有稀释度的结果叠加进来,相当于增大了有效样本量,减少因低孔数带来的随机误差。这是该方法的核心贡献,也是 1938 年原文标题中「simple method」的含义所在。

全部孔都阳性或全部都阴性怎么办?

全阳意味着病毒原液稀释不够,50% 感染点在稀释范围之外;全阴则相反,病毒被稀释过了头。两种情况都无法在已有数据内插值,需要重新设计稀释系数或范围。本工具会提示错误,不会给出无意义的外推结果。

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