log2FC 与倍数变化 (Fold Change) 在线互转
差异表达结果里给的是 log2FC，但讲结果时大家习惯说「上调几倍」。两者的关系是：
FC = 2 ^ log2FC log2FC = log2(FC)
为什么要取 log2？ 因为原始倍数是不对称的：上调 2 倍是 2，下调 2 倍是 0.5。 在 0 到 1 之间挤着所有下调基因，在 1 到无穷之间铺开所有上调基因， 无论画图还是做统计都很别扭。取 log2 之后，上调 2 倍是 +1，下调 2 倍是 −1，围绕 0 对称。
常见阈值对照：
| log2FC | 倍数 | 含义 |
|---|---|---|
| 0.585 | 1.5× | 较宽松，常用于样本量小、效应弱的实验 |
| 1 | 2× | 最常用的默认阈值 |
| 1.585 | 3× | 较严格 |
| 2 | 4× | 只保留强效应 |
必须提醒的是： log2FC 阈值和显著性（p / q 值）是两个独立的筛选条件， 必须同时用。只卡倍数不卡 q 值，低表达基因的随机噪声会产生大量假的高倍数； 只卡 q 值不卡倍数，高表达基因的微小变化也会显著但没有生物学意义。
常见问题
log2FC = -1 是下调多少？
下调到原来的 0.5 倍，也就是减少 50%，习惯说法是「下调 2 倍」。
只卡 log2FC > 1 可以吗？
不建议。必须同时卡校正后的 q 值，否则低表达基因的噪声会伪装成高倍数变化。